D’où vient COVID? L’enquête de l’OMS commence mais fait face à des défis

L’identification de la source sera délicate et les enquêteurs devront s’attaquer à la situation politique délicate.

Vue du marché de gros de fruits de mer de Wuhan Huanan avant sa fermeture.

Les premiers cas de COVID-19 étaient liés à un marché de viande à Wuhan, en Chine, mais les enquêtes n’ont pas trouvé d’échantillons de coronavirus dans les carcasses. Crédit: Alamy

L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a publié son plan pour enquêter sur les origines de la pandémie COVID. La recherche commencera à Wuhan – la ville chinoise où le nouveau coronavirus SARS-CoV-2 a été identifié pour la première fois – et s’étendra à travers la Chine et au-delà. Il est important de tracer la trajectoire du virus pour prévenir les futurs retombées virales, mais les scientifiques affirment que l’équipe de l’OMS est confrontée à une tâche ardue.

La plupart des chercheurs pensent que le virus est originaire de chauves-souris, mais comment il a sauté aux humains est inconnu. D’autres coronavirus sont passés d’un hôte animal intermédiaire; par exemple, le virus qui a provoqué une flambée de syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) en 2002-2004 est probablement venu de chiens viverrins ( Nyctereutes procyonoides ) ou de civettes.

«Trouver un animal infecté par le SRAS-CoV-2, c’est comme chercher une aiguille dans la plus grande botte de foin du monde. Ils ne trouveront peut-être jamais une «chauve-souris fumante» ou un autre animal, dit Angela Rasmussen, virologue à l’Université Columbia à New York. «Il sera essentiel pour les enquêteurs d’établir une relation de collaboration avec les scientifiques et les représentants du gouvernement chinois.»

Clouer les origines d’un virus peut prendre des années, si cela peut être fait, et l’enquête devra également naviguer dans la situation politique très sensible entre la Chine et les États-Unis. Le président américain Donald Trump «l’a qualifié de virus chinois et le gouvernement chinois essaie de tout faire pour prouver qu’il ne s’agit pas d’un virus chinois», déclare Linfa Wang, virologue à la Duke – National University of Singapore Medical School. Le jeu du blâme politique a signifié que des détails cruciaux sur les recherches en cours en Chine n’ont pas été rendus publics, dit Wang, qui faisait partie de la mission de l’OMS qui recherchait l’origine du SRAS en Chine en 2003.

Il espère que la situation avec la nouvelle administration américaine sera moins volatile. Le président élu Joe Biden a également déclaré qu’il annulerait le retrait de Trump de l’OMS . Le soutien de la Chine et des États-Unis créera «un environnement beaucoup plus positif pour mener des recherches dans ce domaine», dit Wang.

La recherche commence à Wuhan

Une équipe internationale d’épidémiologistes, de virologues et de chercheurs ayant une expertise en santé publique, santé animale et sécurité sanitaire des aliments dirigera l’enquête de l’OMS sur le COVID-19. L’agence n’a pas dévoilé leurs noms.

L’équipe a tenu sa première réunion virtuelle, incluant des chercheurs en Chine, le 30 octobre, et examine les preuves préliminaires et élabore des protocoles d’étude, indique l’OMS. La phase initiale des enquêtes à Wuhan sera probablement menée par des chercheurs déjà en Chine, et des chercheurs internationaux se rendront dans le pays après avoir examiné ces résultats, indique l’agence.

À Wuhan, les chercheurs examineront de plus près le marché de la viande et des animaux de Huanan, que beaucoup des premières personnes diagnostiquées avec le COVID-19 avaient visité. Le rôle du marché dans la propagation du virus reste un mystère. Les premières enquêtes ont échantillonné des carcasses d’animaux congelés sur le marché, mais aucune n’a trouvé de preuve du SRAS-CoV-2, selon un rapport du 5 novembre sur le mandat de la mission de l’OMS. Cependant, des échantillons environnementaux, prélevés principalement dans les égouts et les eaux usées, ont été testés positifs pour le virus. «Les études préliminaires n’ont pas généré de pistes crédibles pour restreindre le domaine de la recherche», indique le rapport.

La mission de l’OMS enquêtera sur les animaux sauvages et d’élevage vendus sur le marché, notamment les renards, les ratons laveurs ( Procyon lotor ) et les cerfs sika ( Cervus nippon ). Ils enquêteront également sur d’autres marchés de Wuhan et retraceront les voyages des animaux à travers la Chine et à travers les frontières. Les enquêteurs donneront la priorité aux animaux connus pour être sensibles au virus, comme les chats et les visons.

L’équipe examinera également les dossiers de l’hôpital de Wuhan pour savoir si le virus se propageait avant décembre 2019. Les chercheurs interrogeront les premières personnes identifiées comme ayant eu le COVID-19, pour savoir où elles auraient pu être exposées et effectueront des tests. des échantillons de sang provenant du personnel médical, des techniciens de laboratoire et des ouvriers agricoles prélevés dans les semaines et les mois précédant décembre, à la recherche d’anticorps contre le SRAS-CoV-2. Le rapport reconnaît que certains de ces travaux sont peut-être déjà en cours en Chine.

Plans à plus long terme

L’enquête initiale à Wuhan éclairera des études à plus long terme sur les origines de la pandémie, qui pourraient amener les enquêteurs hors de Chine. «L’endroit où une épidémie est détectée pour la première fois ne reflète pas nécessairement son origine», déclare le rapport de l’OMS, notant les rapports préliminaires d’ARN viral détecté dans des échantillons d’eaux usées avant que les premiers cas aient été identifiés.

Cette déclaration pourrait faire référence à une étude 1 , publiée sur le serveur de pré-impression medRxiv sans examen par les pairs, qui a testé rétrospectivement des échantillons d’eaux usées espagnoles de mars 2019 et trouvé des fragments de SRAS-CoV-2, explique Raina MacIntyre, épidémiologiste à l’Université de New South Wales à Sydney, Australie. «Si cette étude était correcte, nous devons nous demander comment était le virus en Espagne en mars de l’année dernière», dit-elle.

Les plans pour regarder au-delà de la Chine sont raisonnables, étant donné que la surveillance approfondie des chauves-souris en Chine depuis l’épidémie de SRAS de 2002 n’a identifié qu’un parent éloigné du SRAS-CoV-2, dit Wang. Un nombre croissant d’experts pensent que les ancêtres immédiats ou proches du SRAS-CoV-2 sont plus susceptibles d’exister chez les chauves-souris en dehors de la Chine, dit Wang. Il dit que l’équipe de l’OMS devrait enquêter sur les chauves-souris et autres animaux sauvages en Asie du Sud-Est pour les anticorps anti-SRAS-CoV-2.

L’enquête devrait également donner la priorité aux mammifères carnivores élevés pour la fourrure, tels que les chiens viverrins et les civettes, qui ont joué un rôle dans l’épidémie de SRAS, déclare Martin Beer, virologue à l’Institut fédéral de recherche sur la santé animale à Riems, en Allemagne. «Il est surprenant qu’il n’y ait aucune mention de ces animaux dans le rapport, et nous n’avons aucune information en provenance de Chine pour savoir si ces animaux ont été testés», dit Beer.

Un porte-parole de l’OMS a déclaré que la mission sera guidée par la science et «sera ouverte d’esprit, itérative, n’excluant aucune hypothèse qui pourrait contribuer à générer des preuves et à restreindre le champ de la recherche».

Source :
Smriti Mallapaty
Nature

Publié par magrenobloise

Webmagazine

Votre commentaire

Entrez vos coordonnées ci-dessous ou cliquez sur une icône pour vous connecter:

Logo WordPress.com

Vous commentez à l’aide de votre compte WordPress.com. Déconnexion /  Changer )

Photo Google

Vous commentez à l’aide de votre compte Google. Déconnexion /  Changer )

Image Twitter

Vous commentez à l’aide de votre compte Twitter. Déconnexion /  Changer )

Photo Facebook

Vous commentez à l’aide de votre compte Facebook. Déconnexion /  Changer )

Connexion à %s

%d blogueurs aiment cette page :